宋慈升任广东提点刑狱之前，原先的广东官吏很多都不奉行法令，导致积压的案件很多，于是他下令限期清理积案。在他到任短短八个月内，他深入现场察访调查，清理了一大批冤案、错案、悬案、屈打成招的假案，审理了二百多名死囚，其中有些是被陷害和冤屈的无辜者，宋慈不仅为他们平冤昭雪，免除了死刑，同时也惩处了一批贪赃枉法的吏役和逍遥法外的罪犯。由于宋慈“听讼清明，决事刚果”，“以民命为重”，因此，在民众中间赢得了清官的名声。
完成世界上最早的法医专著——《洗冤集录》
在漫长的中国封建时代，一直奉行的是“疑罪从有”的潜规则，冤狱的产生于是便成为不可避免的事情。那么多的冤案、错案使宋慈心中生出一种前所未有的使命感，多年检验工作的实践，使宋慈清楚地认识到，冤案的造成常常起因于微小的误差；鉴定检验发生的错误，则都来自于检验官阅历经验的浅薄。这就是说，错案、冤案最主要的是由于检验不足而造成的。认识到这一点后，他开始博览各朝各代的法医书籍，认真研究了同时代早期著作《内恕录》以及其他一些法医著作。他字斟句酌，对每一章每一节都认真消化，汲其精华，去其谬误，并结合自己长期司法实践的经验积累，终于在1247年，用全部心血编成了一部标准的法医著作——《洗冤集录》。