一九八四年，他的专著《南宋故都杭州》出版，其中有专门章节论述南宋时杭州“星罗棋布的佛寺道观”，他考证了灵隐寺从东晋开始一直延续到南宋的历史文化。
同年，浙江人民出版社听说林正秋对佛教与灵隐寺历史有研究，特别邀请他编写《古刹灵隐》一书，介绍灵隐寺的佛教文化，灵隐寺作为杭州主要景点，这是配合旅游的一本普及性读物。林正秋为此特别写了八万多字的书稿，当时尚未有介绍宗教文化的书。
不料，等到文字清样出校时，情况有了变化。出版社提出，要林自己负责销售三千册才能出版，否则难于成书。由此，此书稿子被束之高阁达十八年之久。
一九八八年，林正秋撰写了《浙江经济文化史研究》，其中列了一个章节，题为“杭州灵隐寺与菩萨简述”，此文三万多字，梳理了灵隐寺的历史沿革，并按灵隐寺入门开始的顺序，依次介绍了寺院中各个菩萨的来历。
从灵隐寺开山祖师，东晋慧理法师创建寺院开始，到初唐四杰之一的骆宾王讨武失败，遁迹灵隐寺的记载；直至吴越国时，灵隐寺高僧名师辈出。