在免疫系统功能减退如接受化疗的人，疱疹病毒可以通过血流扩散至全身，感染其他器官及组织。如果孕妇在临近分娩时感染生殖器疱疹，产科医生会建议行剖腹产手术以避免感染新生儿。
患有生殖器疱疹的人感染HIV病毒、导致艾滋病的危险会增加，因为生殖器疱疹会导致溃疡及出血，提供了病毒进入血液的途径，从而增加感染HIV病毒的危险性。
症状
因为生殖器疱疹通常没有症状，大多数患者不会意识到他们已经被感染。有的病例在接触病毒2～6天后阴茎和女性外阴会出现疼痛、触痛和瘙痒。患者还可能出现发热，头痛，全身无力。生殖器疱疹症状的第一次发作称为原发性疱疹，通常在接触病毒后的2～3周内出现。
出现原发性疱疹时，患者感染病毒的区域开始出现成群的大水泡。对于女性而言，大水泡可能从阴道里面或宫颈表面开始形成，而这两个部位通常不容易被发现。男性和女性都是一样的，水泡也可以发展至大腿和臀部。最终这些大水泡破裂形成的溃疡会引起极度疼痛，可以持续2周。有些人在出现原发性疱疹时会经历严重的症状，包括疼痛、喉咙、腋窝、腹股沟淋巴结增大及流感样症状，包括发热、寒战、头痛和疲乏无力。